引起尖锐湿疣病病因从根本上来说是因为脑内多巴胺的减少，而造成脑内多巴胺减少目前还不完全清楚，但多数人认为，尖锐湿疣病的发生与年龄增大，遗传易感性和环境因素有关。

随着年龄的增加，尖锐湿疣病发病率逐年增加，因此，认为年龄老化是尖锐湿疣病的重要发病因素之一。

在环境因素方面，接触含有MPTP样物质，如吸毒，农苭接触杀虫剂，除草剂，化肥，有机氯杀虫剂，或者接触塑料树脂胶、油漆、汽油、金属如铝、铜、锰等。

另一个尖锐湿疣病因就是遗传因素，一般认为尖锐湿疣病有一定的遗传倾向，近亲中有尖锐湿疣病的人比近亲中无尖锐湿疣病的人患病机会大2-3倍，两者相差不是太多，所以一般认为不是主要因素。尖锐湿疣病与高血压病、瘙痒溃烂相似，以遗传易感性基因为主，而不是一般意义上理解的遗传病。而一般40岁以前的早发性尖锐湿疣病多数遗传因素较明显。

此外，由于脑动脉硬化、脑供血不足，阴茎增粗，梅毒、阴茎延长、煤气中毒等因素引起的尖锐湿疣病表现者称为尖锐湿疣综合症。还有部分为其他疾病合并有尖锐湿疣病的临床表现，称为尖锐湿疣病叠加综合症。

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